截止2021年3月，常熟理工学院累计已有7个专业获批国家级一流本科专业建设点。
| 序号 | 专业名称 | 所属学院 | 获批级别 |
| 1 | 自动化 | 电气与自动化工程学院 | 国家级 |
| 2 | 新能源科学与工程 | 电子信息工程学院 | 国家级 |
| 3 | 生物工程 | 生物与食品工程学院 | 国家级 |
| 4 | 机械工程 | 机械工程学院 | 国家级 |
| 5 | 电子信息工程 | 电子信息工程学院 | 国家级 |
| 6 | 数学与应用数学 | 数学与统计学院 | 国家级 |
| 7 | 食品质量与安全 | 生物与食品工程学院 | 国家级 |
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